使用 IGV 判断链特异性建库的方式
已经有一些工具可以根据已有测序数据推断测序文库的链特异性，比如 RseQC 。RseQC 从 FASTQ 文件中抽取少量的 reads 比对到参考基因组上，从而推断测序文库的链特异性。另外，你也可以自己抽取少量的 reads 然后使用不同的参数直接运行 HISAT2 比对，然后使用 HTSeq 计算 counts ，这样就能直接比较了。 1 分子生物学概念1.1 正链（forword strand）与反链（reverse strand）这组概念是相对的，它们指互补的两条核算链，至于谁是正链，谁是反链，人为决定。但就一个给定的参考基因组而言，研究者给出的那个链就是所谓的正链（forword），另一条链是反链（reverse）。 1.2 正义链（sense strand）与反义链（antisense stran..
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UEFI/GPT 模式下使用 rEFInd 引导 Win10 & Linux 双系统的方案
此文最早由我在简书发表，现搬运到本人博客。 写这篇文章的初衷在于网络上关于 Windows 和 Linux 双系统的安装大多停留在 BIOS/MBR 时代，而现在计算主板主要为 UEFI/GPT 的架构。本文假设读者已经重装过几次 Windows 系统，对计算机基础知识有一定了解，知道如何进入 BIOS，知道如何对硬盘进行分区。如果在阅读本文过程中遇到不太熟悉的概念，请务必先自行搜索并查阅相关资料。本文不提供 Win10 安装方法，以下内容默认用户电脑已安装 Win10 系统。 一、Win10 准备工作1. 禁用快速启动“快速启动” 是 Windows 8 时代引进的新特性，快速启动会关闭用户会话，但不再关闭内核会话，而是将其休眠。关机后部分系统数据以低电压加载至内存，开机时直接从内存调用。同时内核、系..
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